Добрый вечер!
Наверное считыватель MATRIX III RD All ?
Проблема видимо в помехах по линии связи. У вас связхь по RS-422, или RS-485?
Главная причина, это питание. Считыватель потребляет порядка 200 ма. Если расстояние до блока большое, а кинуто тонким проводочком, то будут сильные шумы.
Если работаете по RS-422, то могут мешать наводки по RS-485. Попробуйте замкнуть порт RS-485 (скрутите все четыре провода вместе). Но опять же, наводки по RS-485 это проблема питания.
Удачи.