Добрый вечер!
Определите какая версия прошивки в рабочих считывателях и поставьте ее, сбросьте настройки в заводские.
Т.е. не работают не все брелки, а несколько? Считыватель на них пикает, но в контроллер код не передает? Контроллер точно никак не реагирует, не открывает это понятно, но может как-то пикает (может этих брелков нет в памяти контроллера)?
Не совсем понятно, вы поставили в это место новый считыватель и он так же не работает с Z5R и с теми же брелками?
Сначала нужно определиться, кто виноват. Попробуйте поставить в это место рабочий считыватель, не поможет переставьте рабочий контроллер.
Удачи.