Добрый вечер!
Такая реакция на все карты? Это только в этой программе? Какие у вас карты? Поробуйте в CopyCard. Если будет работать нормально, то нужно разбираться в каком формате выводить код для 1С: Предприятие.
Войдите на страницу считывателя на нашем сайте, там в низу вкладка : + Сопутствующие товары, и ссылка на "Драйвер для подключения к 1С"
Может это то что вам нужно?
Удачи.