На видяхе не видно, у вас только питание и контроллер подключен, или еще чего? Я к тому, что глюка такого у считывателя нет, значит в этот момент, что то мешает считывателю увидеть карту. Или воздействие на DATA, или шумы, наводки , помехи.
Если подключить к считывателю только питание (в идеале аккумулятор, или трансформаторный блок питания), без контроллера, дефект повторится?